Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTF1Q05048 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTF1Q05048 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms