Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTN2Q02246 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTN2Q02246 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNTN2Q02246 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms