Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HDLBPQ00341 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDLBPQ00341 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDLBPQ00341 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HDLBPQ00341 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms