Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAP84074 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPCAP84074 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAP84074 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAP84074 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAP84074 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAP84074 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAP84074 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAP84074 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPCAP84074 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAP84074 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAP84074 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAP84074 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAP84074 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAP84074 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAP84074 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAP84074 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPCAP84074 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAP84074 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAP84074 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAP84074 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAP84074 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAP84074 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAP84074 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAP84074 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAP84074 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAP84074 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAP84074 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAP84074 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAP84074 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAP84074 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAP84074 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAP84074 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAP84074 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAP84074 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAP84074 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAP84074 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAP84074 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAP84074 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAP84074 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAP84074 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAP84074 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAP84074 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAP84074 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAP84074 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAP84074 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAP84074 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAP84074 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAP84074 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAP84074 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HPCAP84074 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAP84074 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAP84074 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAP84074 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAP84074 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAP84074 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAP84074 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAP84074 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAP84074 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAP84074 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAP84074 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAP84074 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAP84074 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAP84074 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAP84074 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAP84074 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAP84074 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAP84074 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAP84074 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAP84074 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAP84074 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAP84074 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAP84074 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAP84074 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAP84074 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAP84074 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPCAP84074 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAP84074 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAP84074 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAP84074 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAP84074 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAP84074 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAP84074 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAP84074 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAP84074 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPCAP84074 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAP84074 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms