Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBP5P82980 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBP5P82980 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBP5P82980 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RBP5P82980 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBP5P82980 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBP5P82980 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBP5P82980 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBP5P82980 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBP5P82980 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBP5P82980 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBP5P82980 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBP5P82980 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBP5P82980 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBP5P82980 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBP5P82980 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBP5P82980 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBP5P82980 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBP5P82980 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBP5P82980 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBP5P82980 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBP5P82980 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RBP5P82980 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBP5P82980 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBP5P82980 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBP5P82980 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBP5P82980 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBP5P82980 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBP5P82980 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBP5P82980 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBP5P82980 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBP5P82980 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBP5P82980 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBP5P82980 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP5P82980 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP5P82980 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP5P82980 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP5P82980 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP5P82980 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP5P82980 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP5P82980 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP5P82980 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP5P82980 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP5P82980 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBP5P82980 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBP5P82980 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBP5P82980 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBP5P82980 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBP5P82980 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBP5P82980 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBP5P82980 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RBP5P82980 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBP5P82980 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBP5P82980 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBP5P82980 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBP5P82980 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBP5P82980 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBP5P82980 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBP5P82980 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBP5P82980 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBP5P82980 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBP5P82980 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBP5P82980 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBP5P82980 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBP5P82980 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBP5P82980 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBP5P82980 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBP5P82980 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBP5P82980 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBP5P82980 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP5P82980 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP5P82980 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP5P82980 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP5P82980 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP5P82980 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP5P82980 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP5P82980 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP5P82980 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP5P82980 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP5P82980 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP5P82980 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBP5P82980 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBP5P82980 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBP5P82980 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBP5P82980 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBP5P82980 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBP5P82980 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBP5P82980 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBP5P82980 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBP5P82980 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBP5P82980 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBP5P82980 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBP5P82980 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBP5P82980 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBP5P82980 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBP5P82980 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBP5P82980 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBP5P82980 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBP5P82980 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBP5P82980 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms