Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2LP62875 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2LP62875 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2LP62875 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms