Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1-1P60608 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVFC1-1P60608 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms