Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEFA3P59666 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEFA3P59666 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEFA3P59666 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms