Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS3P57727 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS3P57727 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS3P57727 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms