Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC13P55735 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC13P55735 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC13P55735 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC13P55735 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC13P55735 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC13P55735 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC13P55735 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC13P55735 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC13P55735 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC13P55735 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC13P55735 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC13P55735 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC13P55735 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC13P55735 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC13P55735 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC13P55735 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC13P55735 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC13P55735 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC13P55735 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC13P55735 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC13P55735 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC13P55735 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC13P55735 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC13P55735 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC13P55735 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC13P55735 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC13P55735 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC13P55735 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC13P55735 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC13P55735 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC13P55735 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC13P55735 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC13P55735 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC13P55735 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC13P55735 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC13P55735 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC13P55735 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC13P55735 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC13P55735 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC13P55735 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC13P55735 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC13P55735 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC13P55735 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC13P55735 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC13P55735 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC13P55735 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC13P55735 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC13P55735 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC13P55735 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC13P55735 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC13P55735 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC13P55735 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC13P55735 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC13P55735 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC13P55735 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC13P55735 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC13P55735 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC13P55735 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC13P55735 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC13P55735 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC13P55735 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC13P55735 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC13P55735 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC13P55735 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC13P55735 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC13P55735 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC13P55735 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC13P55735 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC13P55735 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC13P55735 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC13P55735 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC13P55735 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC13P55735 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC13P55735 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC13P55735 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC13P55735 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC13P55735 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC13P55735 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC13P55735 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC13P55735 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC13P55735 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC13P55735 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC13P55735 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC13P55735 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC13P55735 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC13P55735 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC13P55735 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC13P55735 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC13P55735 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC13P55735 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC13P55735 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC13P55735 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC13P55735 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC13P55735 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC13P55735 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC13P55735 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC13P55735 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC13P55735 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC13P55735 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms