Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP12AP54707 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP12AP54707 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms