Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMSP52788 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMSP52788 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMSP52788 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMSP52788 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMSP52788 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMSP52788 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMSP52788 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMSP52788 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMSP52788 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMSP52788 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMSP52788 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMSP52788 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMSP52788 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMSP52788 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMSP52788 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMSP52788 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMSP52788 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMSP52788 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMSP52788 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMSP52788 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMSP52788 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMSP52788 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMSP52788 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMSP52788 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMSP52788 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMSP52788 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMSP52788 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMSP52788 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMSP52788 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMSP52788 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMSP52788 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMSP52788 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMSP52788 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMSP52788 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMSP52788 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMSP52788 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMSP52788 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMSP52788 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SMSP52788 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMSP52788 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMSP52788 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMSP52788 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMSP52788 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMSP52788 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMSP52788 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMSP52788 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMSP52788 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMSP52788 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMSP52788 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMSP52788 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMSP52788 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMSP52788 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMSP52788 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMSP52788 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMSP52788 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMSP52788 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMSP52788 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMSP52788 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMSP52788 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMSP52788 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMSP52788 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMSP52788 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMSP52788 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMSP52788 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMSP52788 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMSP52788 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMSP52788 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMSP52788 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMSP52788 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMSP52788 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMSP52788 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMSP52788 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMSP52788 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMSP52788 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMSP52788 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMSP52788 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMSP52788 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMSP52788 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMSP52788 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMSP52788 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMSP52788 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMSP52788 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMSP52788 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMSP52788 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMSP52788 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMSP52788 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMSP52788 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMSP52788 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMSP52788 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMSP52788 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMSP52788 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMSP52788 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMSP52788 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMSP52788 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMSP52788 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMSP52788 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMSP52788 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMSP52788 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMSP52788 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms