Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK3P51956 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK3P51956 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK3P51956 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK3P51956 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK3P51956 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK3P51956 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK3P51956 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEK3P51956 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK3P51956 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK3P51956 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK3P51956 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK3P51956 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK3P51956 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK3P51956 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK3P51956 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK3P51956 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK3P51956 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK3P51956 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK3P51956 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK3P51956 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK3P51956 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK3P51956 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK3P51956 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK3P51956 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK3P51956 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK3P51956 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK3P51956 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK3P51956 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK3P51956 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK3P51956 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK3P51956 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK3P51956 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK3P51956 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK3P51956 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK3P51956 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK3P51956 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK3P51956 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK3P51956 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK3P51956 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEK3P51956 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK3P51956 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK3P51956 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK3P51956 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK3P51956 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK3P51956 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK3P51956 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK3P51956 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK3P51956 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK3P51956 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK3P51956 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK3P51956 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK3P51956 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK3P51956 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK3P51956 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK3P51956 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK3P51956 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK3P51956 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK3P51956 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK3P51956 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK3P51956 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK3P51956 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK3P51956 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK3P51956 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK3P51956 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK3P51956 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK3P51956 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK3P51956 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK3P51956 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK3P51956 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK3P51956 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK3P51956 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK3P51956 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK3P51956 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK3P51956 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK3P51956 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK3P51956 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK3P51956 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK3P51956 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK3P51956 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK3P51956 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK3P51956 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK3P51956 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK3P51956 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK3P51956 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK3P51956 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK3P51956 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK3P51956 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms