Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPS6KA3P51812 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS6KA3P51812 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA3P51812 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms