Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC43.15■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC43.13■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC43.08■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
SMARCA2P51531 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
SMARCA2P51531 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC43■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
SMARCA2P51531 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
SMARCA2P51531 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC42.88■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC42.88■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
SMARCA2P51531 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms