Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSEN1P49768 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSEN1P49768 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms