Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)22.07■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)21.01■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 AGBL5-203ENST00000421915 559 ntTSL 413.83□□□□□ -0.21e-323■■■■■ 52.5
AARSP49588 AGBL5-207ENST00000453161 673 ntTSL 313.82□□□□□ -0.21e-323■■■■■ 52.5
AARSP49588 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 LINC00963-216ENST00000623185 786 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 LINC00963-220ENST00000625171 830 ntTSL 512.57□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 LINC00963-219ENST00000624390 472 ntTSL 59.01□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 LINC00963-215ENST00000622972 444 ntTSL 56.29□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 52.5
AARSP49588 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.558e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.428e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-217ENST00000527644 968 ntTSL 228.58■■■□□ 2.178e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.078e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.048e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.048e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.998e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SMS-203ENST00000457085 931 ntTSL 527.35■■□□□ 1.978e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.978e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NLGN2-203ENST00000572893 305 ntTSL 326.69■■□□□ 1.868e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.858e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.848e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.828e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.818e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FBXW11-208ENST00000520376 686 ntTSL 226.26■■□□□ 1.798e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.778e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 VDAC1-204ENST00000425992 703 ntTSL 325.76■■□□□ 1.718e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SETD5-209ENST00000431285 1824 ntTSL 525.68■■□□□ 1.78e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.688e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.658e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.648e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.648e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.638e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HMG20B-201ENST00000262949 886 ntTSL 525.04■■□□□ 1.68e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.538e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CLCN7-204ENST00000561665 561 ntTSL 424.56■■□□□ 1.528e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.518e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 224.49■■□□□ 1.518e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HMG20B-205ENST00000435022 616 ntTSL 524.32■■□□□ 1.488e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSH6-202ENST00000411819 548 ntTSL 424.22■■□□□ 1.478e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HMG20B-203ENST00000416526 711 ntTSL 323.78■■□□□ 1.48e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HMG20B-206ENST00000453933 759 ntTSL 223.69■■□□□ 1.388e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CIRBP-219ENST00000588411 619 ntTSL 523.65■■□□□ 1.388e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.358e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)23.45■■□□□ 1.348e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 R3HDM4-202ENST00000586080 537 ntTSL 423.44■■□□□ 1.348e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.328e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RRM2B-210ENST00000523957 603 ntTSL 523.27■■□□□ 1.328e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.318e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-218ENST00000566180 814 ntTSL 523.17■■□□□ 1.38e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.298e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.268e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SH3D21-201ENST00000453908 2408 ntAPPRIS P1 TSL 522.92■■□□□ 1.268e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HMG20B-204ENST00000417382 561 ntTSL 422.89■■□□□ 1.258e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.258e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFS2-204ENST00000467295 1060 ntTSL 322.87■■□□□ 1.258e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.248e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CLCN7-210ENST00000566812 434 ntTSL 422.67■■□□□ 1.228e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FBXW11-210ENST00000522507 306 ntTSL 322.66■■□□□ 1.228e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.218e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-219ENST00000530404 818 ntTSL 522.54■■□□□ 1.28e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CLCN7-211ENST00000567139 581 ntTSL 222.48■■□□□ 1.198e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.188e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-212ENST00000564822 314 ntTSL 422.38■■□□□ 1.178e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-226ENST00000570051 735 ntTSL 222.38■■□□□ 1.178e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.178e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 LMF1-204ENST00000562226 1088 ntTSL 222.35■■□□□ 1.178e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.158e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.158e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.158e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TRIM13-203ENST00000378183 1251 ntTSL 222.22■■□□□ 1.158e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.148e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.148e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 UTP4-203ENST00000562237 2186 ntTSL 1 (best)21.99■■□□□ 1.118e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CIRBP-239ENST00000592467 796 ntTSL 221.95■■□□□ 1.18e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.18e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HMG20B-213ENST00000488973 2434 ntTSL 1 (best)21.94■■□□□ 1.18e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 221.91■■□□□ 1.18e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.088e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.078e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.078e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF513-203ENST00000436006 510 ntTSL 221.68■■□□□ 1.068e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-212ENST00000580492 553 ntTSL 521.52■■□□□ 1.048e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAZ-207ENST00000563012 646 ntTSL 321.51■■□□□ 1.038e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 221.49■■□□□ 1.038e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.038e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.038e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.018e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.018e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.018e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 18e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.998e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.988e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RRM2B-208ENST00000522368 1613 ntTSL 221.15■□□□□ 0.988e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-216ENST00000582710 846 ntTSL 521.14■□□□□ 0.978e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFS2-208ENST00000478866 1076 ntTSL 221.13■□□□□ 0.978e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.978e-6■■■■■ 52.4
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 63.4 ms