Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTAP49354 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTAP49354 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTAP49354 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTAP49354 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTAP49354 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTAP49354 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTAP49354 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNTAP49354 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNTAP49354 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNTAP49354 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNTAP49354 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNTAP49354 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNTAP49354 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNTAP49354 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNTAP49354 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNTAP49354 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNTAP49354 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNTAP49354 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNTAP49354 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNTAP49354 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNTAP49354 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNTAP49354 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNTAP49354 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNTAP49354 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNTAP49354 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FNTAP49354 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNTAP49354 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNTAP49354 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNTAP49354 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNTAP49354 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNTAP49354 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNTAP49354 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNTAP49354 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNTAP49354 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNTAP49354 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNTAP49354 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNTAP49354 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNTAP49354 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNTAP49354 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNTAP49354 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNTAP49354 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNTAP49354 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNTAP49354 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNTAP49354 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNTAP49354 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNTAP49354 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNTAP49354 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FNTAP49354 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNTAP49354 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNTAP49354 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNTAP49354 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNTAP49354 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNTAP49354 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNTAP49354 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNTAP49354 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNTAP49354 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNTAP49354 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNTAP49354 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNTAP49354 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNTAP49354 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNTAP49354 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNTAP49354 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNTAP49354 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNTAP49354 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNTAP49354 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FNTAP49354 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNTAP49354 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNTAP49354 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNTAP49354 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNTAP49354 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNTAP49354 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNTAP49354 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FNTAP49354 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNTAP49354 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNTAP49354 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNTAP49354 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNTAP49354 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNTAP49354 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNTAP49354 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNTAP49354 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNTAP49354 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNTAP49354 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FNTAP49354 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNTAP49354 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FNTAP49354 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNTAP49354 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNTAP49354 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNTAP49354 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNTAP49354 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNTAP49354 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNTAP49354 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNTAP49354 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNTAP49354 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNTAP49354 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNTAP49354 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNTAP49354 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNTAP49354 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNTAP49354 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FNTAP49354 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms