Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSNK1DP48730 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSNK1DP48730 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSNK1DP48730 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms