Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LRPPRCP42704 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LRPPRCP42704 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LRPPRCP42704 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
LRPPRCP42704 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LRPPRCP42704 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LRPPRCP42704 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LRPPRCP42704 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LRPPRCP42704 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LRPPRCP42704 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
LRPPRCP42704 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LRPPRCP42704 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
LRPPRCP42704 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.81■■■■□ 3
LRPPRCP42704 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
LRPPRCP42704 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
LRPPRCP42704 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LRPPRCP42704 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LRPPRCP42704 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LRPPRCP42704 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
LRPPRCP42704 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
LRPPRCP42704 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LRPPRCP42704 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
LRPPRCP42704 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LRPPRCP42704 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LRPPRCP42704 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.78■■■■□ 3
LRPPRCP42704 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LRPPRCP42704 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
LRPPRCP42704 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LRPPRCP42704 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LRPPRCP42704 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LRPPRCP42704 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
LRPPRCP42704 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
LRPPRCP42704 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LRPPRCP42704 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
LRPPRCP42704 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
LRPPRCP42704 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LRPPRCP42704 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
LRPPRCP42704 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LRPPRCP42704 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LRPPRCP42704 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms