Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX2P40425 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX2P40425 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX2P40425 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX2P40425 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX2P40425 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX2P40425 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PBX2P40425 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX2P40425 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX2P40425 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX2P40425 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX2P40425 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PBX2P40425 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PBX2P40425 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBX2P40425 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBX2P40425 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PBX2P40425 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX2P40425 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX2P40425 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX2P40425 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PBX2P40425 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX2P40425 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PBX2P40425 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX2P40425 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX2P40425 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX2P40425 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX2P40425 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX2P40425 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX2P40425 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PBX2P40425 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX2P40425 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX2P40425 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX2P40425 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX2P40425 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX2P40425 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PBX2P40425 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBX2P40425 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBX2P40425 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PBX2P40425 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX2P40425 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX2P40425 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX2P40425 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX2P40425 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PBX2P40425 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX2P40425 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX2P40425 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX2P40425 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX2P40425 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PBX2P40425 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX2P40425 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX2P40425 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX2P40425 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX2P40425 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX2P40425 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PBX2P40425 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX2P40425 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX2P40425 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX2P40425 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PBX2P40425 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX2P40425 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX2P40425 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX2P40425 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX2P40425 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX2P40425 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX2P40425 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX2P40425 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PBX2P40425 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PBX2P40425 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PBX2P40425 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PBX2P40425 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PBX2P40425 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PBX2P40425 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PBX2P40425 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PBX2P40425 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PBX2P40425 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PBX2P40425 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PBX2P40425 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PBX2P40425 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PBX2P40425 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PBX2P40425 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PBX2P40425 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PBX2P40425 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PBX2P40425 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PBX2P40425 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PBX2P40425 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX2P40425 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PBX2P40425 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms