Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
THPOP40225 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THPOP40225 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THPOP40225 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
THPOP40225 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THPOP40225 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
THPOP40225 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THPOP40225 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
THPOP40225 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
THPOP40225 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
THPOP40225 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
THPOP40225 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THPOP40225 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THPOP40225 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
THPOP40225 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
THPOP40225 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
THPOP40225 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
THPOP40225 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
THPOP40225 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
THPOP40225 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
THPOP40225 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
THPOP40225 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
THPOP40225 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
THPOP40225 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
THPOP40225 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
THPOP40225 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
THPOP40225 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
THPOP40225 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
THPOP40225 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
THPOP40225 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
THPOP40225 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
THPOP40225 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
THPOP40225 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
THPOP40225 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
THPOP40225 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
THPOP40225 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
THPOP40225 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
THPOP40225 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
THPOP40225 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
THPOP40225 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
THPOP40225 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
THPOP40225 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
THPOP40225 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
THPOP40225 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
THPOP40225 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
THPOP40225 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
THPOP40225 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
THPOP40225 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
THPOP40225 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
THPOP40225 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
THPOP40225 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
THPOP40225 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
THPOP40225 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
THPOP40225 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
THPOP40225 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
THPOP40225 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
THPOP40225 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
THPOP40225 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
THPOP40225 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
THPOP40225 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
THPOP40225 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
THPOP40225 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
THPOP40225 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THPOP40225 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THPOP40225 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THPOP40225 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THPOP40225 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THPOP40225 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THPOP40225 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THPOP40225 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THPOP40225 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THPOP40225 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THPOP40225 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THPOP40225 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THPOP40225 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THPOP40225 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THPOP40225 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THPOP40225 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THPOP40225 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THPOP40225 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THPOP40225 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
THPOP40225 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THPOP40225 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THPOP40225 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THPOP40225 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THPOP40225 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THPOP40225 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THPOP40225 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THPOP40225 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THPOP40225 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THPOP40225 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms