Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBRP36941 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBRP36941 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBRP36941 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBRP36941 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBRP36941 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBRP36941 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBRP36941 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBRP36941 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBRP36941 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBRP36941 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBRP36941 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBRP36941 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBRP36941 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LTBRP36941 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBRP36941 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBRP36941 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBRP36941 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LTBRP36941 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBRP36941 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBRP36941 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBRP36941 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBRP36941 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBRP36941 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBRP36941 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBRP36941 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBRP36941 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBRP36941 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LTBRP36941 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBRP36941 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBRP36941 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBRP36941 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBRP36941 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBRP36941 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LTBRP36941 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBRP36941 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBRP36941 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LTBRP36941 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBRP36941 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBRP36941 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBRP36941 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBRP36941 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBRP36941 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBRP36941 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBRP36941 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBRP36941 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBRP36941 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBRP36941 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBRP36941 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBRP36941 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBRP36941 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBRP36941 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBRP36941 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBRP36941 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBRP36941 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBRP36941 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBRP36941 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBRP36941 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBRP36941 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBRP36941 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBRP36941 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBRP36941 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBRP36941 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBRP36941 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBRP36941 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBRP36941 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LTBRP36941 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBRP36941 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBRP36941 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBRP36941 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBRP36941 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBRP36941 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBRP36941 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBRP36941 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBRP36941 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBRP36941 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBRP36941 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBRP36941 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBRP36941 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBRP36941 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBRP36941 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBRP36941 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTBRP36941 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBRP36941 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBRP36941 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTBRP36941 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBRP36941 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBRP36941 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBRP36941 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LTBRP36941 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBRP36941 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBRP36941 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBRP36941 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LTBRP36941 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBRP36941 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBRP36941 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBRP36941 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBRP36941 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBRP36941 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LTBRP36941 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms