Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RORAP35398 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RORAP35398 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RORAP35398 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RORAP35398 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RORAP35398 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RORAP35398 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RORAP35398 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RORAP35398 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORAP35398 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORAP35398 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RORAP35398 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORAP35398 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORAP35398 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORAP35398 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORAP35398 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORAP35398 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RORAP35398 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORAP35398 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RORAP35398 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORAP35398 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORAP35398 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORAP35398 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORAP35398 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORAP35398 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RORAP35398 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORAP35398 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORAP35398 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORAP35398 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORAP35398 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORAP35398 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RORAP35398 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RORAP35398 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORAP35398 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORAP35398 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORAP35398 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORAP35398 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RORAP35398 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORAP35398 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORAP35398 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORAP35398 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RORAP35398 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORAP35398 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORAP35398 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORAP35398 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORAP35398 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RORAP35398 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORAP35398 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORAP35398 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RORAP35398 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORAP35398 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RORAP35398 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RORAP35398 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORAP35398 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORAP35398 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORAP35398 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORAP35398 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORAP35398 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORAP35398 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RORAP35398 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORAP35398 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORAP35398 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RORAP35398 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORAP35398 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RORAP35398 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORAP35398 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORAP35398 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORAP35398 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORAP35398 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORAP35398 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RORAP35398 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORAP35398 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORAP35398 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORAP35398 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORAP35398 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORAP35398 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RORAP35398 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RORAP35398 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RORAP35398 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RORAP35398 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RORAP35398 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RORAP35398 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RORAP35398 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORAP35398 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORAP35398 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORAP35398 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RORAP35398 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms