Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP2C19P33261 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CYP2C19P33261 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP2C19P33261 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms