Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC12P31275 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXC12P31275 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC12P31275 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms