Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL4A5P29400 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL4A5P29400 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A5P29400 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A5P29400 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms