Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4AP27815 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4AP27815 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms