Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DNMT1P26358 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
DNMT1P26358 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DNMT1P26358 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
DNMT1P26358 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms