Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTGS1P23219 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTGS1P23219 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTGS1P23219 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTGS1P23219 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTGS1P23219 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTGS1P23219 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTGS1P23219 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTGS1P23219 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTGS1P23219 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTGS1P23219 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTGS1P23219 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTGS1P23219 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTGS1P23219 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTGS1P23219 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PTGS1P23219 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTGS1P23219 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTGS1P23219 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTGS1P23219 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGS1P23219 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGS1P23219 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGS1P23219 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTGS1P23219 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGS1P23219 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PTGS1P23219 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTGS1P23219 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTGS1P23219 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTGS1P23219 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTGS1P23219 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTGS1P23219 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGS1P23219 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTGS1P23219 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGS1P23219 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTGS1P23219 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTGS1P23219 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms