Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMPD1P17405 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMPD1P17405 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMPD1P17405 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms