Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB3P14651 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB3P14651 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB3P14651 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXB3P14651 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms