Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCL5P13501 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCL5P13501 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL5P13501 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL5P13501 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL5P13501 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL5P13501 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL5P13501 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL5P13501 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL5P13501 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL5P13501 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL5P13501 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL5P13501 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL5P13501 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL5P13501 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL5P13501 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL5P13501 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL5P13501 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL5P13501 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL5P13501 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL5P13501 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL5P13501 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL5P13501 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL5P13501 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL5P13501 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL5P13501 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL5P13501 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCL5P13501 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCL5P13501 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCL5P13501 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCL5P13501 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCL5P13501 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCL5P13501 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCL5P13501 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCL5P13501 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCL5P13501 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCL5P13501 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL5P13501 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL5P13501 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL5P13501 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL5P13501 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL5P13501 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL5P13501 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL5P13501 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL5P13501 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL5P13501 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL5P13501 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL5P13501 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL5P13501 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL5P13501 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCL5P13501 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCL5P13501 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCL5P13501 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCL5P13501 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCL5P13501 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCL5P13501 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCL5P13501 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCL5P13501 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCL5P13501 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCL5P13501 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCL5P13501 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCL5P13501 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCL5P13501 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCL5P13501 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCL5P13501 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCL5P13501 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCL5P13501 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL5P13501 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL5P13501 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL5P13501 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL5P13501 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL5P13501 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL5P13501 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL5P13501 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL5P13501 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL5P13501 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCL5P13501 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCL5P13501 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCL5P13501 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCL5P13501 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCL5P13501 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCL5P13501 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCL5P13501 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCL5P13501 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCL5P13501 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCL5P13501 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCL5P13501 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCL5P13501 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCL5P13501 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCL5P13501 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCL5P13501 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCL5P13501 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCL5P13501 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCL5P13501 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL5P13501 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL5P13501 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL5P13501 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL5P13501 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL5P13501 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL5P13501 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms