Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4P13236 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4P13236 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4P13236 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4P13236 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL4P13236 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4P13236 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4P13236 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4P13236 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL4P13236 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL4P13236 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL4P13236 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL4P13236 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL4P13236 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL4P13236 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL4P13236 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL4P13236 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL4P13236 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL4P13236 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL4P13236 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL4P13236 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL4P13236 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCL4P13236 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL4P13236 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL4P13236 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL4P13236 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL4P13236 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL4P13236 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL4P13236 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL4P13236 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL4P13236 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL4P13236 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL4P13236 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL4P13236 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL4P13236 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL4P13236 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCL4P13236 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL4P13236 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL4P13236 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL4P13236 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL4P13236 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL4P13236 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL4P13236 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL4P13236 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL4P13236 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL4P13236 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL4P13236 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL4P13236 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL4P13236 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL4P13236 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL4P13236 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL4P13236 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL4P13236 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL4P13236 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL4P13236 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL4P13236 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL4P13236 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL4P13236 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL4P13236 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL4P13236 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCL4P13236 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCL4P13236 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL4P13236 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL4P13236 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL4P13236 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL4P13236 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL4P13236 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL4P13236 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL4P13236 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL4P13236 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL4P13236 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL4P13236 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL4P13236 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL4P13236 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL4P13236 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL4P13236 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4P13236 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4P13236 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4P13236 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4P13236 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4P13236 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4P13236 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4P13236 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4P13236 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4P13236 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL4P13236 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4P13236 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4P13236 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4P13236 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4P13236 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4P13236 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4P13236 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4P13236 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL4P13236 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4P13236 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4P13236 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4P13236 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4P13236 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4P13236 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL4P13236 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms