Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD1P0DJD0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RGPD1P0DJD0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RGPD1P0DJD0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RGPD1P0DJD0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms