Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM13P0DJ93 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM13P0DJ93 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms