Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFHP08603 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFHP08603 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFHP08603 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFHP08603 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFHP08603 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFHP08603 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFHP08603 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFHP08603 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFHP08603 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFHP08603 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFHP08603 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFHP08603 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CFHP08603 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFHP08603 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFHP08603 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFHP08603 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFHP08603 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFHP08603 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFHP08603 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFHP08603 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHP08603 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHP08603 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHP08603 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHP08603 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHP08603 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHP08603 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHP08603 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFHP08603 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFHP08603 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFHP08603 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFHP08603 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFHP08603 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFHP08603 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFHP08603 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFHP08603 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFHP08603 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFHP08603 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFHP08603 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFHP08603 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFHP08603 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFHP08603 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFHP08603 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFHP08603 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFHP08603 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CFHP08603 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFHP08603 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFHP08603 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CFHP08603 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFHP08603 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFHP08603 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFHP08603 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFHP08603 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFHP08603 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CFHP08603 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFHP08603 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFHP08603 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFHP08603 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFHP08603 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFHP08603 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFHP08603 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFHP08603 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFHP08603 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFHP08603 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFHP08603 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFHP08603 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFHP08603 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHP08603 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHP08603 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHP08603 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHP08603 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHP08603 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHP08603 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHP08603 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHP08603 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHP08603 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFHP08603 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFHP08603 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFHP08603 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFHP08603 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFHP08603 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFHP08603 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFHP08603 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFHP08603 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFHP08603 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFHP08603 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFHP08603 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFHP08603 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFHP08603 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFHP08603 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFHP08603 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFHP08603 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFHP08603 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFHP08603 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFHP08603 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFHP08603 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFHP08603 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFHP08603 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFHP08603 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFHP08603 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms