Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB2P05107 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGB2P05107 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGB2P05107 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms