Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TIMP1P01033 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TIMP1P01033 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TIMP1P01033 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMP1P01033 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TIMP1P01033 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms