Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF12O95522 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF12O95522 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF12O95522 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF12O95522 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms