Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX4O95219 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX4O95219 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX4O95219 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX4O95219 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX4O95219 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX4O95219 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX4O95219 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX4O95219 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX4O95219 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX4O95219 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX4O95219 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX4O95219 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX4O95219 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX4O95219 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX4O95219 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX4O95219 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX4O95219 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX4O95219 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX4O95219 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX4O95219 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX4O95219 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX4O95219 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX4O95219 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX4O95219 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX4O95219 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX4O95219 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX4O95219 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX4O95219 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX4O95219 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX4O95219 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX4O95219 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX4O95219 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX4O95219 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX4O95219 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX4O95219 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX4O95219 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX4O95219 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX4O95219 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX4O95219 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX4O95219 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX4O95219 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX4O95219 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX4O95219 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX4O95219 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX4O95219 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX4O95219 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX4O95219 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX4O95219 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX4O95219 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX4O95219 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX4O95219 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX4O95219 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX4O95219 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX4O95219 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX4O95219 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX4O95219 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX4O95219 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX4O95219 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX4O95219 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX4O95219 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX4O95219 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX4O95219 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX4O95219 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX4O95219 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX4O95219 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX4O95219 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX4O95219 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX4O95219 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX4O95219 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX4O95219 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX4O95219 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX4O95219 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX4O95219 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX4O95219 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX4O95219 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX4O95219 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX4O95219 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX4O95219 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX4O95219 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX4O95219 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX4O95219 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX4O95219 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX4O95219 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX4O95219 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX4O95219 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX4O95219 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX4O95219 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX4O95219 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX4O95219 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX4O95219 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms