Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLOT1O75955 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FLOT1O75955 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FLOT1O75955 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FLOT1O75955 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FLOT1O75955 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FLOT1O75955 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FLOT1O75955 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FLOT1O75955 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FLOT1O75955 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FLOT1O75955 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
FLOT1O75955 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
FLOT1O75955 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FLOT1O75955 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FLOT1O75955 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FLOT1O75955 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FLOT1O75955 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FLOT1O75955 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLOT1O75955 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLOT1O75955 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLOT1O75955 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FLOT1O75955 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FLOT1O75955 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FLOT1O75955 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FLOT1O75955 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FLOT1O75955 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FLOT1O75955 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FLOT1O75955 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLOT1O75955 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLOT1O75955 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FLOT1O75955 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FLOT1O75955 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FLOT1O75955 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FLOT1O75955 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLOT1O75955 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms