Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN11O75508 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN11O75508 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN11O75508 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN11O75508 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN11O75508 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN11O75508 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN11O75508 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN11O75508 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms