Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAP30O75446 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAP30O75446 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAP30O75446 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAP30O75446 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAP30O75446 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SAP30O75446 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAP30O75446 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAP30O75446 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAP30O75446 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAP30O75446 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAP30O75446 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAP30O75446 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAP30O75446 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAP30O75446 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAP30O75446 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAP30O75446 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAP30O75446 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAP30O75446 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAP30O75446 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAP30O75446 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAP30O75446 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAP30O75446 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAP30O75446 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAP30O75446 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAP30O75446 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAP30O75446 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SAP30O75446 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAP30O75446 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAP30O75446 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAP30O75446 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAP30O75446 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAP30O75446 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAP30O75446 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAP30O75446 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAP30O75446 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAP30O75446 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAP30O75446 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAP30O75446 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAP30O75446 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAP30O75446 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAP30O75446 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAP30O75446 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAP30O75446 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SAP30O75446 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SAP30O75446 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAP30O75446 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAP30O75446 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAP30O75446 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAP30O75446 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAP30O75446 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAP30O75446 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAP30O75446 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAP30O75446 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAP30O75446 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAP30O75446 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAP30O75446 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAP30O75446 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAP30O75446 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAP30O75446 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAP30O75446 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms