Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCXO43602 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCXO43602 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCXO43602 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCXO43602 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCXO43602 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCXO43602 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCXO43602 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCXO43602 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCXO43602 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCXO43602 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DCXO43602 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCXO43602 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCXO43602 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCXO43602 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCXO43602 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCXO43602 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCXO43602 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCXO43602 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCXO43602 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCXO43602 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCXO43602 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCXO43602 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCXO43602 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCXO43602 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DCXO43602 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DCXO43602 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCXO43602 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DCXO43602 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCXO43602 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCXO43602 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCXO43602 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DCXO43602 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DCXO43602 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DCXO43602 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DCXO43602 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DCXO43602 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DCXO43602 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCXO43602 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCXO43602 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCXO43602 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DCXO43602 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCXO43602 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCXO43602 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCXO43602 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCXO43602 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCXO43602 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCXO43602 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCXO43602 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCXO43602 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCXO43602 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCXO43602 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCXO43602 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCXO43602 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCXO43602 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCXO43602 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCXO43602 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCXO43602 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCXO43602 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCXO43602 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCXO43602 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCXO43602 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCXO43602 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCXO43602 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCXO43602 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCXO43602 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCXO43602 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCXO43602 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCXO43602 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCXO43602 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCXO43602 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCXO43602 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCXO43602 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCXO43602 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCXO43602 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCXO43602 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCXO43602 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCXO43602 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCXO43602 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DCXO43602 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DCXO43602 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCXO43602 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCXO43602 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCXO43602 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCXO43602 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCXO43602 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCXO43602 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCXO43602 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCXO43602 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCXO43602 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DCXO43602 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCXO43602 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DCXO43602 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCXO43602 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCXO43602 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCXO43602 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCXO43602 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCXO43602 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DCXO43602 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCXO43602 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms