Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SYNJ2O15056 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
SYNJ2O15056 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
SYNJ2O15056 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SYNJ2O15056 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms