Protein–RNA interactions for Protein: O14657

TOR1B, Torsin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1BO14657 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOR1BO14657 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR1BO14657 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1BO14657 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms