Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC1A7O00341 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC1A7O00341 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC1A7O00341 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC1A7O00341 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC1A7O00341 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms