Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QKU1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QKU1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QKU1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QKU1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QKU1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QKU1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QKU1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QKU1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QKU1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QKU1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QKU1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QKU1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QKU1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QKU1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QKU1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QKU1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QKU1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QKU1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QKU1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QKU1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QKU1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QKU1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QKU1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QKU1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QKU1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QKU1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QKU1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QKU1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QKU1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QKU1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QKU1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QKU1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QKU1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QKU1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QKU1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QKU1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QKU1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QKU1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QKU1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QKU1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QKU1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QKU1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QKU1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QKU1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QKU1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QKU1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QKU1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QKU1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QKU1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QKU1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QKU1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QKU1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QKU1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QKU1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QKU1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QKU1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
J3QKU1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QKU1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QKU1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QKU1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QKU1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QKU1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QKU1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QKU1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QKU1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QKU1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QKU1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QKU1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QKU1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QKU1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QKU1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QKU1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QKU1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QKU1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QKU1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QKU1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QKU1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QKU1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.3■■□□□ 1
J3QKU1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QKU1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
J3QKU1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QKU1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QKU1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.3■■□□□ 1
J3QKU1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QKU1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QKU1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QKU1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QKU1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QKU1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QKU1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
J3QKU1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.29■■□□□ 1
J3QKU1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
J3QKU1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QKU1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QKU1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QKU1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QKU1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QKU1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QKU1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms