Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMX2-CTNND1H3BSU7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMX2-CTNND1H3BSU7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms